Ioannis Armakolas este profesor asociat de politică comparată a Europei de Sud-Est la Universitatea din Macedonia (Salonic), cercetător principal la nou-înființatul Centru de cunoaștere al Uniunii Europene privind prevenirea radicalizării și cercetător principal și șef al Programului pentru Europa de Sud-Est la Fundația Elenă pentru Politică Europeană și Externă (ELIAMEP), cel mai important think tank din Grecia în domeniul politicii externe; de asemenea, este cercetător invitat la Centrul Robert Schuman al Institutului Universitar European din Florența. Profesorul Armakolas este membru al rețelei „Europe’s Futures” a Fundației Erste (Viena), membru al Grupului tripartit independent la nivel înalt privind interdependențele de vecinătate ale UE (Bruxelles) și editor al seriei de cărți „Southeast European and Black Sea Series”, publicată de editura Taylor & Francis. El activează în calitate de membru pro bono al Grupului de lucru pentru înființarea Biroului de cooperare bilaterală pentru tineret între Grecia și Macedonia de Nord, pe baza Acordului de la Prespa care a soluționat așa-numitul „conflict privind denumirea”.

Printre afilierile sale anterioare se numără: bursier al programului „Europe’s Futures” la Institutul pentru Științe Umane din Viena, redactor-șef al revistei „Southeast European and Black Sea Studies” (reviste Routledge, Taylor & Francis); bursier ESRC la Departamentul de Științe Politice al Universității din Oxford; cercetător la Nuffield College, Universitatea din Oxford; director de cercetare în cadrul „Grupului de lucru SUA-Grecia: Transformarea Balcanilor” (proiect comun al Centrului Elen pentru Studii Europene și al Centrului pentru Studii Strategice și Internaționale din Washington); șef de regiune pentru Europa de Sud-Est la Oxford Analytica; bursier Tip O’Neill în studii de pace și conflicte la INCORE-Irlanda de Nord (Universitatea din Ulster și Universitatea Națiunilor Unite). Profesorul Armakolas are o vastă experiență în calitate de consultant pentru Comisia Europeană, USAID, Ministerul Afacerilor Externe și al Commonwealth-ului, Departamentul pentru Dezvoltare Internațională al Regatului Unit, Fundația Friedrich Ebert din Germania și proiectele Fundațiilor Open Society din Balcanii de Vest, precum și pentru companii precum KPMG Consulting Inc., BearingPoint, Coffey International și TSGN.

Profesorul Armakolas deține un doctorat cu specializare în conflicte etnice și securitate de la Universitatea din Cambridge și un masterat în relații internaționale de la Universitatea din Kent, Canterbury.